Das Erscheinen des Spiels ging einher mit einer zweifelhaften Vorbestellerpolitik und etlichen Updates, die Deus Ex Mankind Divided mit allen Spielinhalten locker auf 60 Gigabyte anwachsen lassen. Zusätzliche Elemente fürs Spiel und die eigenständige Tüftel-Erweiterung "Breach" sind teils unnötig, können aber überteuert erkauft werden. Zudem loggt sich das Spiel standardmäßig online ein und sammelt Datenerhebungen. Das sollte man sofort im Optionsmenü ausschalten. Glitches, wie aus dem Vorgänger berüchtigt, sind seltener, aber besonders Kisten zappeln immer noch wild herum, wenn man sie an gewissen Stellen absetzt. Die Sprachsynchronisation ist nicht immer lippensynchron und teils hört man Sprache ohne jegliche Mund-Bewegung der Figur. Die künstliche Intelligenz, beziehungsweise das Verhalten von Gegnern und Begleitern, ist arg begrenzt.